La finalidad de este programa es conocer el tipo y cantidad de organismos presentes en el sistema lagunar con base a los tres grupos principales que se recomienda evaluar para este tipo de trabajos: plancton, necton y bentos.

Este programa comprende dos fases: la primera que nos permitió conocer la dinámica de los organismos que viven en el agua de la Bahía de Ohuira, y la segunda fase, en la que se evaluará a todo el sistema lagunar Santa María - Topolobampo - Ohuira.

Los estudios realizados por el Centro Interdisciplinario de Investigación para el Desarrollo Integral Regional (CIIDIR) indican que la estructura y composición de la flora y fauna acuática están limitadas por la baja concentración de oxígeno presente en la bahía.

Si bien existe en el agua disponibilidad de recursos primarios para sostener la cadena alimentaria (plancton: microrganismos que flotan en el agua), éstos se encuentran en malas condiciones, lo cual ha ocasionado que el crecimiento de los organismos que se desplazan en el agua (necton), como el camarón, jaiba, peces y otros organismos, también se vea limitado, tanto en diversidad como en cantidad.

De igual manera, se encuentran los organismos que viven en el fondo de la bahía (bentos), los cuales han sido afectados por los escurrimientos de canales, drenes agrícolas, área urbana, pesca y turismo.